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Revision 221 Nov 2007 - Main.RodrigoZucoloto

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INFORMAÇÕES SOBRE O LABIOCOMP

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2. Área de pesquisa

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2.1. Bioinformática: Análise de seqüências dos bancos de dados genômicos públicos (via internet) que possam resolver problemas biológicos interessantes e anotação de genomas. 2.2. Evolução e filogenia molecular: Estudos de filogenia baseados na análise de sequenciamentos produzidos localmente no laboratório de Biologia Molecular. 2.3. Genética de populações: Análises por marcadores moleculares aplicados a resolução de questões biológicas.
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2.1. Bioinformática: Análise de seqüências dos bancos de dados genômicos públicos (via internet) que possam resolver problemas biológicos interessantes e anotação de genomas.
 
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3. Material utilizado

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2.2. Evolução e filogenia molecular: Estudos de filogenia baseados na análise de sequenciamentos produzidos localmente no laboratório de Biologia Molecular.
 
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O LaBioComp? conta hoje com 4 CPUs em funcionamento (1 Pentium IV de 1 Gb RAM, 1 AMD K7 de 256 Mb RAM, 1 Pentium II de 128 Mb RAM e 1 Pentium II de 64 Mb RAM, além de outras 24 CPUs, sendo 7 Pentium II de 64 Mb RAM e 17 AMDs K6 de 64 Mb RAM que serão utilizadas para a instalação de um cluster para computação científica.
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2.3. Genética de populações: Análises por marcadores moleculares aplicados a resolução de questões biológicas.
 
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4. Equipe

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3. Equipe

 
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4.1. Professores:
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3.1. Professores:
  Prof. Dr. Rodrigo Barban Zucoloto
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 Profa. Dra. Flora Maria de Campos Fernandes
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4.2. Alunos:
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3.2. Alunos:
  Thiago José de Santana
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 Gabriel Muricy Cunha
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 Tarsisio Melo Araújo
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 João Vitor Batisti
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4.3. Colaboradores:
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3.3. Colaboradores:
  Mauricio Bomfim Cruz Vieira
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5. Projetos

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4. Projetos de pesquisa

 
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Projetos de Pesquisa
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2004 - Atual - Projeto de desenvolvimento da infra-estrutura do Laboratório de Biologia Computacional do Instituto de Biologia da Universidade Federal da Bahia

 
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2004 - Atual - Projeto de desenvolvimento da infra-estrutura do Laboratório de Biologia Computacional do Instituto de Biologia da Universidade Federal da Bahia

Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

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Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
  Alunos envolvidos: Graduação ( 1) .
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Integrantes: Luciana Veiga Barbosa - Integrante / João Vitor Batisti - Integrante / Mauricio Bomfim Cruz Vieira - Integrante / Charbel Niño El-Hani - Integrante / Rodrigo Barban Zucoloto - Coordenador.
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Integrantes: Luciana Veiga Barbosa - Integrante / João Vitor Batisti - Integrante / Mauricio Bomfim Cruz Vieira - Integrante / Charbel Niño El-Hani - Integrante / Rodrigo Barban Zucoloto - Coordenador.

Finaciador(es): Universidade Federal da Bahia - Outra..

2007 - Atual - Genética molecular para estudos de filogenia e conservação biológica de vertebrados e invertebrados do MZUFBA

Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

Alunos envolvidos: Graduação ( 3) / Mestrado acadêmico ( 1) .

Integrantes: Carla Maria Menegola da Silva - Integrante / Orane Falcão de Souza Alves - Integrante / Flora Maria de Campos Fernandes - Integrante / Ângela Maria Zanata - Integrante / Rodrigo Johnsson Tavares da Silva - Integrante / Elizabeth Gerardo Neves - Integrante / Tania Kobler Brazil - Integrante / Rodrigo Barban Zucoloto - Coordenador.

5. Supervisões e orientações concluídas

Trabalho de conclusão de curso de graduação

1. Patrícia Maria Sousa de Abreu. Contribuições da análise de seqüências de DNA à reconstrução filogenética dos grandes grupos de Anura.. 2005. 51 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal da Bahia. Orientador: Rodrigo Barban Zucoloto.

 
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Finaciador(es): Universidade Federal da Bahia - Outra..
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2. César Raimundo Lima Costa Junior. Estudo da genealogia do grupo protéico RNA replicase através do critério de máxima verossimilhança. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal da Bahia. Orientador: Rodrigo Barban Zucoloto.
 
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2007 - Atual - Genética molecular para estudos de filogenia e conservação biológica de vertebrados e invertebrados do MZUFBA

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Iniciação Científica
 
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Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
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1. César Raimundo Lima Costa Júnior. Análise genealógica do grupo protéico DNA primase. 2007. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal da Bahia, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia. Orientador: Rodrigo Barban Zucoloto.
 
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Alunos envolvidos: Graduação ( 3) / Mestrado acadêmico ( 1) .
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2. César Raimundo Lima Costa Júnior. Análise de similaridade do grupo protéico: RNA replicase. 2006. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal da Bahia. Orientador: Rodrigo Barban Zucoloto.
 
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Integrantes: Carla Maria Menegola da Silva - Integrante / Orane Falcão de Souza Alves - Integrante / Flora Maria de Campos Fernandes - Integrante / Ângela Maria Zanata - Integrante / Rodrigo Johnsson Tavares da Silva - Integrante / Elizabeth Gerardo Neves - Integrante / Tania Kobler Brazil - Integrante / Rodrigo Barban Zucoloto - Coordenador.
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3. Théo de Araújo Santos. Análise de similaridade do grupo protéico: transcriptase reversa. 2006. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal da Bahia, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia. Orientador: Rodrigo Barban Zucoloto.
 
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6. Artigos em revistas QUALIS A

 
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COSTA JR CRL, ZUCOLOTO RB, FERNANDES FMC (em preparação). Estudo da genealogia do grupo protéico RNA replicase através do critério de máxima verossimilhança. Genetics and molecular Biology.
  -- RodrigoZucoloto - 21 Nov 2007

Revision 121 Nov 2007 - Main.RodrigoZucoloto

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INFORMAÇÕES SOBRE O LABIOCOMP

1. Nome e histórico

Fundado em 2004 pelo Prof. Dr. Rodrigo Barban Zucoloto, o Laboratório de Biologia Computacional (Labiocomp) foi provisoriamente instalado nas dependências da antiga sala de reuniões do departamento, local onde ainda se encontra. A infra-estrutura física destinada como definitiva pelo departamento a este laboratório localiza-se na antiga biblioteca do instituto e encontrasse em fase de reforma e adequação às atividades ai desenvolvidas.O Labiocomp em acordo com o professor Charbel, encontrasse associado a estrutura do NCIB (Núcleo de Computação Inspirada na Biologia).

2. Área de pesquisa

2.1. Bioinformática: Análise de seqüências dos bancos de dados genômicos públicos (via internet) que possam resolver problemas biológicos interessantes e anotação de genomas. 2.2. Evolução e filogenia molecular: Estudos de filogenia baseados na análise de sequenciamentos produzidos localmente no laboratório de Biologia Molecular. 2.3. Genética de populações: Análises por marcadores moleculares aplicados a resolução de questões biológicas.

3. Material utilizado

O LaBioComp? conta hoje com 4 CPUs em funcionamento (1 Pentium IV de 1 Gb RAM, 1 AMD K7 de 256 Mb RAM, 1 Pentium II de 128 Mb RAM e 1 Pentium II de 64 Mb RAM, além de outras 24 CPUs, sendo 7 Pentium II de 64 Mb RAM e 17 AMDs K6 de 64 Mb RAM que serão utilizadas para a instalação de um cluster para computação científica.

4. Equipe

4.1. Professores:

Prof. Dr. Rodrigo Barban Zucoloto Profa. Dra. Flora Maria de Campos Fernandes

4.2. Alunos:

Thiago José de Santana Gabriel Muricy Cunha Tarsisio Melo Araújo João Vitor Batisti

4.3. Colaboradores:

Mauricio Bomfim Cruz Vieira

5. Projetos

Projetos de Pesquisa

2004 - Atual - Projeto de desenvolvimento da infra-estrutura do Laboratório de Biologia Computacional do Instituto de Biologia da Universidade Federal da Bahia

Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

Alunos envolvidos: Graduação ( 1) .

Integrantes: Luciana Veiga Barbosa - Integrante / João Vitor Batisti - Integrante / Mauricio Bomfim Cruz Vieira - Integrante / Charbel Niño El-Hani - Integrante / Rodrigo Barban Zucoloto - Coordenador.

Finaciador(es): Universidade Federal da Bahia - Outra..

2007 - Atual - Genética molecular para estudos de filogenia e conservação biológica de vertebrados e invertebrados do MZUFBA

Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

Alunos envolvidos: Graduação ( 3) / Mestrado acadêmico ( 1) .

Integrantes: Carla Maria Menegola da Silva - Integrante / Orane Falcão de Souza Alves - Integrante / Flora Maria de Campos Fernandes - Integrante / Ângela Maria Zanata - Integrante / Rodrigo Johnsson Tavares da Silva - Integrante / Elizabeth Gerardo Neves - Integrante / Tania Kobler Brazil - Integrante / Rodrigo Barban Zucoloto - Coordenador.

-- RodrigoZucoloto - 21 Nov 2007

 
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