Difference: HistoricoLabiocomp (1 vs. 7)

Revision 701 Oct 2013 - Main.RodrigoZucoloto

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INFORMAÇÕES SOBRE O LABIOCOMP

1. Nome e histórico

Fundado em 2004 pelo Prof. Dr. Rodrigo Barban Zucoloto, o Laboratório de Biologia Computacional (LABIOCOMP) foi provisoriamente instalado nas dependências da antiga sala de reuniões do Departamento de Biologia Geral, local onde ainda se encontra. A infra-estrutura física destinada como definitiva pelo departamento a este laboratório localiza-se na antiga biblioteca do instituto e encontrasse em fase de reforma e adequação às atividades ai desenvolvidas. O LABIOCOMP em acordo com o professor Charbel, está associado a estrutura do NCIB (Núcleo de Computação Inspirada na Biologia).

2. Área de pesquisa

2.1. Bioinformática: Análise de seqüências dos bancos de dados genômicos públicos (via internet) que possam resolver problemas biológicos interessantes e anotação de genomas.

2.2. Evolução e filogenia molecular: Estudos de filogenia baseados na análise de sequenciamentos produzidos localmente no Laboratório de Biologia Molecular.

2.3. Genética de populações: Análises por marcadores moleculares aplicados a resolução de questões biológicas.

3. Equipe

3.1. Professores:

Prof. Dr. Rodrigo Barban Zucoloto

Profa. Dra. Flora Maria de Campos Fernandes

3.2. Alunos:

Tarsisio Melo Araújo

Laercio Moreira Cardoso Junior

3.3. Colaboradores:

Mauricio Bomfim Cruz Vieira

4. Projetos de pesquisa

2004 - Atual - Projeto de desenvolvimento da infra-estrutura do Laboratório de Biologia Computacional do Instituto de Biologia da Universidade Federal da Bahia

Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

Alunos envolvidos: Graduação ( 1) .

Integrantes: Luciana Veiga Barbosa - Integrante / João Vitor Batisti - Integrante / Mauricio Bomfim Cruz Vieira - Integrante / Charbel Niño El-Hani - Integrante / Rodrigo Barban Zucoloto - Coordenador.

Finaciador(es): Universidade Federal da Bahia - Outra..

2007 - Atual - Genética molecular para estudos de filogenia e conservação biológica de vertebrados e invertebrados do MZUFBA

Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

Alunos envolvidos: Graduação ( 3) / Mestrado acadêmico ( 1) .

Integrantes: Carla Maria Menegola da Silva - Integrante / Orane Falcão de Souza Alves - Integrante / Flora Maria de Campos Fernandes - Integrante / Ângela Maria Zanata - Integrante / Rodrigo Johnsson Tavares da Silva - Integrante / Elizabeth Gerardo Neves - Integrante / Tania Kobler Brazil - Integrante / Rodrigo Barban Zucoloto - Coordenador.

5. Supervisões e orientações concluídas

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1. WebHome. 2. DocuMentacoes. 3. HistoricoLabiocomp

1. Orientações concluídas

  Trabalho de conclusão de curso de graduação
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  3. Théo de Araújo Santos. Análise de similaridade do grupo protéico: transcriptase reversa. 2006. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal da Bahia, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia. Orientador: Rodrigo Barban Zucoloto.
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6. Artigos em revistas QUALIS A

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2. Artigos em revistas QUALIS A

  COSTA JR CRL, ZUCOLOTO RB, FERNANDES FMC (em preparação). Estudo da genealogia do grupo protéico RNA replicase através do critério de máxima verossimilhança. Genetics and molecular Biology.

Revision 624 Feb 2010 - Main.RodrigoZucoloto

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INFORMAÇÕES SOBRE O LABIOCOMP

Revision 525 Sep 2008 - Main.RodrigoZucoloto

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INFORMAÇÕES SOBRE O LABIOCOMP

Line: 24 to 24
  3.2. Alunos:
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Thiago José de Santana

Gabriel Muricy Cunha

 Tarsisio Melo Araújo
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João Vitor Batisti
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Laercio Moreira Cardoso Junior
  3.3. Colaboradores:

Revision 423 Nov 2007 - Main.RodrigoZucoloto

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INFORMAÇÕES SOBRE O LABIOCOMP

1. Nome e histórico

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Fundado em 2004 pelo Prof. Dr. Rodrigo Barban Zucoloto, o Laboratório de Biologia Computacional (Labiocomp) foi provisoriamente instalado nas dependências da antiga sala de reuniões do Departamento de Biologia Geral, local onde ainda se encontra. A infra-estrutura física destinada como definitiva pelo departamento a este laboratório localiza-se na antiga biblioteca do instituto e encontrasse em fase de reforma e adequação às atividades ai desenvolvidas.O Labiocomp em acordo com o professor Charbel, está associado a estrutura do NCIB (Núcleo de Computação Inspirada na Biologia).
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Fundado em 2004 pelo Prof. Dr. Rodrigo Barban Zucoloto, o Laboratório de Biologia Computacional (LABIOCOMP) foi provisoriamente instalado nas dependências da antiga sala de reuniões do Departamento de Biologia Geral, local onde ainda se encontra. A infra-estrutura física destinada como definitiva pelo departamento a este laboratório localiza-se na antiga biblioteca do instituto e encontrasse em fase de reforma e adequação às atividades ai desenvolvidas. O LABIOCOMP em acordo com o professor Charbel, está associado a estrutura do NCIB (Núcleo de Computação Inspirada na Biologia).
 

2. Área de pesquisa

Revision 322 Nov 2007 - Main.RodrigoZucoloto

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INFORMAÇÕES SOBRE O LABIOCOMP

1. Nome e histórico

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Fundado em 2004 pelo Prof. Dr. Rodrigo Barban Zucoloto, o Laboratório de Biologia Computacional (Labiocomp) foi provisoriamente instalado nas dependências da antiga sala de reuniões do departamento, local onde ainda se encontra. A infra-estrutura física destinada como definitiva pelo departamento a este laboratório localiza-se na antiga biblioteca do instituto e encontrasse em fase de reforma e adequação às atividades ai desenvolvidas.O Labiocomp em acordo com o professor Charbel, encontrasse associado a estrutura do NCIB (Núcleo de Computação Inspirada na Biologia).
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Fundado em 2004 pelo Prof. Dr. Rodrigo Barban Zucoloto, o Laboratório de Biologia Computacional (Labiocomp) foi provisoriamente instalado nas dependências da antiga sala de reuniões do Departamento de Biologia Geral, local onde ainda se encontra. A infra-estrutura física destinada como definitiva pelo departamento a este laboratório localiza-se na antiga biblioteca do instituto e encontrasse em fase de reforma e adequação às atividades ai desenvolvidas.O Labiocomp em acordo com o professor Charbel, está associado a estrutura do NCIB (Núcleo de Computação Inspirada na Biologia).
 

2. Área de pesquisa

2.1. Bioinformática: Análise de seqüências dos bancos de dados genômicos públicos (via internet) que possam resolver problemas biológicos interessantes e anotação de genomas.

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2.2. Evolução e filogenia molecular: Estudos de filogenia baseados na análise de sequenciamentos produzidos localmente no laboratório de Biologia Molecular.
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2.2. Evolução e filogenia molecular: Estudos de filogenia baseados na análise de sequenciamentos produzidos localmente no Laboratório de Biologia Molecular.
  2.3. Genética de populações: Análises por marcadores moleculares aplicados a resolução de questões biológicas.

Revision 221 Nov 2007 - Main.RodrigoZucoloto

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INFORMAÇÕES SOBRE O LABIOCOMP

Line: 8 to 8
 

2. Área de pesquisa

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2.1. Bioinformática: Análise de seqüências dos bancos de dados genômicos públicos (via internet) que possam resolver problemas biológicos interessantes e anotação de genomas. 2.2. Evolução e filogenia molecular: Estudos de filogenia baseados na análise de sequenciamentos produzidos localmente no laboratório de Biologia Molecular. 2.3. Genética de populações: Análises por marcadores moleculares aplicados a resolução de questões biológicas.
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2.1. Bioinformática: Análise de seqüências dos bancos de dados genômicos públicos (via internet) que possam resolver problemas biológicos interessantes e anotação de genomas.
 
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3. Material utilizado

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2.2. Evolução e filogenia molecular: Estudos de filogenia baseados na análise de sequenciamentos produzidos localmente no laboratório de Biologia Molecular.
 
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O LaBioComp? conta hoje com 4 CPUs em funcionamento (1 Pentium IV de 1 Gb RAM, 1 AMD K7 de 256 Mb RAM, 1 Pentium II de 128 Mb RAM e 1 Pentium II de 64 Mb RAM, além de outras 24 CPUs, sendo 7 Pentium II de 64 Mb RAM e 17 AMDs K6 de 64 Mb RAM que serão utilizadas para a instalação de um cluster para computação científica.
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2.3. Genética de populações: Análises por marcadores moleculares aplicados a resolução de questões biológicas.
 
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4. Equipe

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3. Equipe

 
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4.1. Professores:
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3.1. Professores:
  Prof. Dr. Rodrigo Barban Zucoloto
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 Profa. Dra. Flora Maria de Campos Fernandes
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4.2. Alunos:
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3.2. Alunos:
  Thiago José de Santana
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 Gabriel Muricy Cunha
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 Tarsisio Melo Araújo
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 João Vitor Batisti
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4.3. Colaboradores:
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3.3. Colaboradores:
  Mauricio Bomfim Cruz Vieira
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5. Projetos

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4. Projetos de pesquisa

 
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Projetos de Pesquisa
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2004 - Atual - Projeto de desenvolvimento da infra-estrutura do Laboratório de Biologia Computacional do Instituto de Biologia da Universidade Federal da Bahia

 
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2004 - Atual - Projeto de desenvolvimento da infra-estrutura do Laboratório de Biologia Computacional do Instituto de Biologia da Universidade Federal da Bahia

Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

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Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
  Alunos envolvidos: Graduação ( 1) .
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Integrantes: Luciana Veiga Barbosa - Integrante / João Vitor Batisti - Integrante / Mauricio Bomfim Cruz Vieira - Integrante / Charbel Niño El-Hani - Integrante / Rodrigo Barban Zucoloto - Coordenador.
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Integrantes: Luciana Veiga Barbosa - Integrante / João Vitor Batisti - Integrante / Mauricio Bomfim Cruz Vieira - Integrante / Charbel Niño El-Hani - Integrante / Rodrigo Barban Zucoloto - Coordenador.

Finaciador(es): Universidade Federal da Bahia - Outra..

2007 - Atual - Genética molecular para estudos de filogenia e conservação biológica de vertebrados e invertebrados do MZUFBA

Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

Alunos envolvidos: Graduação ( 3) / Mestrado acadêmico ( 1) .

Integrantes: Carla Maria Menegola da Silva - Integrante / Orane Falcão de Souza Alves - Integrante / Flora Maria de Campos Fernandes - Integrante / Ângela Maria Zanata - Integrante / Rodrigo Johnsson Tavares da Silva - Integrante / Elizabeth Gerardo Neves - Integrante / Tania Kobler Brazil - Integrante / Rodrigo Barban Zucoloto - Coordenador.

5. Supervisões e orientações concluídas

Trabalho de conclusão de curso de graduação

1. Patrícia Maria Sousa de Abreu. Contribuições da análise de seqüências de DNA à reconstrução filogenética dos grandes grupos de Anura.. 2005. 51 f. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal da Bahia. Orientador: Rodrigo Barban Zucoloto.

 
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Finaciador(es): Universidade Federal da Bahia - Outra..
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2. César Raimundo Lima Costa Junior. Estudo da genealogia do grupo protéico RNA replicase através do critério de máxima verossimilhança. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso. (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal da Bahia. Orientador: Rodrigo Barban Zucoloto.
 
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2007 - Atual - Genética molecular para estudos de filogenia e conservação biológica de vertebrados e invertebrados do MZUFBA

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Iniciação Científica
 
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Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.
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1. César Raimundo Lima Costa Júnior. Análise genealógica do grupo protéico DNA primase. 2007. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal da Bahia, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia. Orientador: Rodrigo Barban Zucoloto.
 
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Alunos envolvidos: Graduação ( 3) / Mestrado acadêmico ( 1) .
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2. César Raimundo Lima Costa Júnior. Análise de similaridade do grupo protéico: RNA replicase. 2006. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal da Bahia. Orientador: Rodrigo Barban Zucoloto.
 
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Integrantes: Carla Maria Menegola da Silva - Integrante / Orane Falcão de Souza Alves - Integrante / Flora Maria de Campos Fernandes - Integrante / Ângela Maria Zanata - Integrante / Rodrigo Johnsson Tavares da Silva - Integrante / Elizabeth Gerardo Neves - Integrante / Tania Kobler Brazil - Integrante / Rodrigo Barban Zucoloto - Coordenador.
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3. Théo de Araújo Santos. Análise de similaridade do grupo protéico: transcriptase reversa. 2006. Iniciação Científica. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal da Bahia, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia. Orientador: Rodrigo Barban Zucoloto.
 
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6. Artigos em revistas QUALIS A

 
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COSTA JR CRL, ZUCOLOTO RB, FERNANDES FMC (em preparação). Estudo da genealogia do grupo protéico RNA replicase através do critério de máxima verossimilhança. Genetics and molecular Biology.
  -- RodrigoZucoloto - 21 Nov 2007

Revision 121 Nov 2007 - Main.RodrigoZucoloto

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INFORMAÇÕES SOBRE O LABIOCOMP

1. Nome e histórico

Fundado em 2004 pelo Prof. Dr. Rodrigo Barban Zucoloto, o Laboratório de Biologia Computacional (Labiocomp) foi provisoriamente instalado nas dependências da antiga sala de reuniões do departamento, local onde ainda se encontra. A infra-estrutura física destinada como definitiva pelo departamento a este laboratório localiza-se na antiga biblioteca do instituto e encontrasse em fase de reforma e adequação às atividades ai desenvolvidas.O Labiocomp em acordo com o professor Charbel, encontrasse associado a estrutura do NCIB (Núcleo de Computação Inspirada na Biologia).

2. Área de pesquisa

2.1. Bioinformática: Análise de seqüências dos bancos de dados genômicos públicos (via internet) que possam resolver problemas biológicos interessantes e anotação de genomas. 2.2. Evolução e filogenia molecular: Estudos de filogenia baseados na análise de sequenciamentos produzidos localmente no laboratório de Biologia Molecular. 2.3. Genética de populações: Análises por marcadores moleculares aplicados a resolução de questões biológicas.

3. Material utilizado

O LaBioComp? conta hoje com 4 CPUs em funcionamento (1 Pentium IV de 1 Gb RAM, 1 AMD K7 de 256 Mb RAM, 1 Pentium II de 128 Mb RAM e 1 Pentium II de 64 Mb RAM, além de outras 24 CPUs, sendo 7 Pentium II de 64 Mb RAM e 17 AMDs K6 de 64 Mb RAM que serão utilizadas para a instalação de um cluster para computação científica.

4. Equipe

4.1. Professores:

Prof. Dr. Rodrigo Barban Zucoloto Profa. Dra. Flora Maria de Campos Fernandes

4.2. Alunos:

Thiago José de Santana Gabriel Muricy Cunha Tarsisio Melo Araújo João Vitor Batisti

4.3. Colaboradores:

Mauricio Bomfim Cruz Vieira

5. Projetos

Projetos de Pesquisa

2004 - Atual - Projeto de desenvolvimento da infra-estrutura do Laboratório de Biologia Computacional do Instituto de Biologia da Universidade Federal da Bahia

Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

Alunos envolvidos: Graduação ( 1) .

Integrantes: Luciana Veiga Barbosa - Integrante / João Vitor Batisti - Integrante / Mauricio Bomfim Cruz Vieira - Integrante / Charbel Niño El-Hani - Integrante / Rodrigo Barban Zucoloto - Coordenador.

Finaciador(es): Universidade Federal da Bahia - Outra..

2007 - Atual - Genética molecular para estudos de filogenia e conservação biológica de vertebrados e invertebrados do MZUFBA

Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

Alunos envolvidos: Graduação ( 3) / Mestrado acadêmico ( 1) .

Integrantes: Carla Maria Menegola da Silva - Integrante / Orane Falcão de Souza Alves - Integrante / Flora Maria de Campos Fernandes - Integrante / Ângela Maria Zanata - Integrante / Rodrigo Johnsson Tavares da Silva - Integrante / Elizabeth Gerardo Neves - Integrante / Tania Kobler Brazil - Integrante / Rodrigo Barban Zucoloto - Coordenador.

-- RodrigoZucoloto - 21 Nov 2007

 
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